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--- samtools-0.1.18/Makefile.orig 2018-03-06 16:29:49 UTC
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+++ samtools-0.1.18/Makefile
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@@ -1,5 +1,5 @@
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-CC= gcc
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-CFLAGS= -g -Wall -fsigned-char -O2 #-m64 #-arch ppc
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+CC?= gcc
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+CFLAGS?= -g -Wall -fsigned-char -O2 #-m64 #-arch ppc
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DFLAGS= -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_CURSES_LIB=0 #-D_USE_KNETFILE
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KNETFILE_O= knetfile.o
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LOBJS= bgzf.o kstring.o bam_aux.o bam.o bam_import.o sam.o bam_index.o \
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